事情還沒處理完，工科給事中吳文佳又對神宗說："棱恩門、殿等處沉陷甚多，至于寶城磚石翻塌損傷，更為可慮。"神宗隨即命工部侍郎陳一松、給事中胡汝欽再去陵園察勘?；貋砗髨蠓Q：陵園沉陷嚴重，棱恩殿丹陛、方墻等處都有程度不同的沉陷、閃動，與陶金、王淑陵所奏相差懸殊。神宗覽奏十分生氣，馬上命都察院會同工部對肇事人員進行參處。這次處罰比上次更為嚴厲，周宣、郭全各降三級，革去管事職務；熊汝達已致仕，著冠帶閑住，恩蔭罷革；易可義、石漢各降三級，調外任；等法司從重問擬；朱衡著以尚書致仕；楊俊卿等監(jiān)工人員四人各降一級，郭元相奪俸半年；馬錄等法司提問。

　　陶金、王淑陵因報告的時間與陳、胡二人察看的時間相差一月，其間大雨連綿，沉陷陸續(xù)增多，免以虛報處罰。

　　由于昭陵棱恩門、棱恩殿、垣墻等處嚴重沉陷，萬歷三年(1575年)正月，神宗不得不委派工部左侍郎陳一松等提督再修昭陵。七月，陵工告竣。

　　由于昭陵多次興工，耗費了大量的人力和物力。第一次興工(指地面建筑)，萬歷元年十月工部盤查營建所用錢糧數(shù)，計用庫銀390932兩，還不包括其中神木等三廠的木植用銀、大通橋廠的白城磚用銀、大石窩等廠舊石料的折銀及戶、兵二部雇抵班軍工食行糧等用銀。萬歷元年十二月，巡視廠庫工科給事中梁式等查盤營建昭陵所用錢糧數(shù)，除工部上述實用銀外，又有戶、兵二部銀110119兩，總計用銀50105O兩有奇。其中；營繕司用銀204422兩，虞衡司13145兩，都水司118854兩，屯田司164628兩。

　　第二次接修用銀數(shù)，文獻中沒有明確記載。但據(jù)《明熹宗實錄》記載，前后兩次修建共用銀150余萬兩。這還不算嘉靖時營建玄宮的費用。如算上嘉靖年間營陵的費用，其總用度至少在200萬兩以上，幾乎相當于隆慶時一年的財政總收入（隆慶年間歲入約230余萬兩)。由于營建昭陵需要龐大的錢糧開支，工部庫銀匱乏到了極點。萬歷二年八月修繕涿州橋，工部拿不出銀兩，兵部派不出軍匠，不得不由輔臣張居正請求萬歷皇帝懇請母親解囊捐銀，雇工修建。

三、建筑特點

　　(一)十三陵中首創(chuàng)"啞巴院"之制

　　昭陵的陵寢制度在十三陵中屬中等規(guī)模。其神道的設置，從長陵神道七空橋北向西分出，長約2公里。途中建有五空、單空石橋各一座。近陵處建碑亭一座，亭后建并列單空石橋三座。陵宮建筑，朝向為南偏東38度，占地約3.46萬平方米。其總體布局亦呈前方后圓之形，寶城前設兩進院落，方城下甬道作直通前后的方式，以及棱恩殿、配殿為五間，棱恩門為三間的規(guī)制均如泰、康諸陵制度。

　　昭陵的最大特點，是率先形成了完備的"啞巴院"制度。明朝的帝陵從獻陵到康陵前后六陵,寶城內的封土都是從寶城內環(huán)形排水溝以內開始夯筑"寶山"(墓冢)的，其形狀呈自然隆起之態(tài)。《昌平山水記》記之為"甬道平，寶城小，冢半填"。昭陵則不同，寶城內的封土填得特別滿，幾乎與寶城墻等高，正中筑有上小下大的柱形夯土墓冢，封土的前部有弧形磚墻攔擋封土，并與方城兩側的寶城墻內壁相接，形成了一個封閉的月牙形院落，人們俗稱為"啞巴院"，并稱院外月牙形的墻體為"月牙城"。